人間性豊かな良医の育成を教育目的として、自学自習を重視した6年一貫の医学教育を実施している。 医学および医療の専門家としての学識と技術とを身につけ、同時に幅広い教養と温かい人間性を兼ね備えた行動的な医師・医学者の育成を目的としている。
第1学年は枚方市にある緑濃い閑静な牧野学舎で、総合人間医学1や基本的科目を学ぶ。その後の5年間は、大阪市に隣接する守口市にある滝井学舎で基礎・社会医学ならびに臨床医学を学び、近代設備を誇る3つの付属病院で医療チームの一員となって臨床実習（クリニカル・クラークシップ）を履修する。
教員は、教育のみならず生活指導に熱心で、学生は教員を信頼して自主的に学業に励み、教職員、学生、同窓生が協力し合い、家族的な雰囲気を醸成しつつ、自由、自律、自学という学風を育んでいる。研究設備も充実しており、特色ある医学研究が活発に行われ、世界的にも高い研究評価を受けている。